差别的话其实不少，在这里简单的阐述几项，希望对你有所帮助。

系统门窗：是一个性能系统的完美有机组合，此类门窗需考虑各种性能，如水密性、气密性、抗风压、隔热、隔音、防盗、操作手感等，还要按照整体解决方案要求，考虑设备、型材、配件、玻璃、粘胶、密封件各环节性能的综合结果，终形成高性能的系统门窗。
断桥铝门窗：断桥铝又叫隔热断桥铝，隔热铝合金，断桥铝合金。它是一种两面为铝材，中间用塑料型材腔体做断热材料的隔热型铝材，以断桥铝为材料制作而成的窗户称为断桥铝门窗。
系统门窗与普通断桥铝门窗形象地比喻为“电脑”，和“组装电脑”，这样形容大家应该更好理解吧，简单的对比就可发现，系统门窗其成本与单价都比普通断桥铝金门窗要高。但一分钱一分货，系统门窗“贵”在型材、五金等有形成本上，以及研发设计、后期服务、综合性能”等方面。